2011-09-22
DICOMからアナライズフォーマットへの一括変換
フォルダ構造が
ルートフォルダ->被験者->DICOMフォルダ
->出力フォルダ
となっている場合,
以下のスクリプトで多数の被験者のDICOMを
一括で*.niiに変換。
root_dir='**********';
cd(root_dir);
sub_list=dir;
for ii=3:length(sub_list)
cd(sub_list(ii).name);
folder_list=dir;
cd(folder_list(3).name);
dicom_list=dir;
clear P;
for jj=3:length(dicom_list)
P(jj-2,:)=strcat(root_dir,'\',sub_list(ii).name,'\',folder_list(3).name,'\',dicom_list(jj).name);
end;
cd('..');
cd('Analyze_format');
hdr = spm_dicom_headers(P);
spm_dicom_convert(hdr,'all','flat','nii');
cd(root_dir);
end;
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