BRAPH

グラフ理論解析のグラフィカルツールボックス。
名前がセンスある。

論文
http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0178798
ダウンロード
http://braph.org/software/
指標の説明が非常によい
http://braph.org/manual/graph-measures/