cocoa： 安静時fMRIに興味あるけど解析面倒そうな研究者に向けたツールボックス

大人の事情により，安静時fMRI解析のマットラボツールボックスを作成しました。

Comprehensive Connectivity Analysis（cocoa）

安静時fMRIの解析は百花繚乱，群雄割拠なわけですが，比較的標準的な解析ができればいいやという研究者向けに，細かい設定なしに，またコマンドラインを使うことなく，わずか数回のクリックだけで解析ができるように作りました。

安静時fMRIの解析初級者から中級者向けです。


cocoaでできること

・標準的な事前処理（SPM）
・ROI-to-ROI解析，ROI-to-Voxel解析（CONN）
・グラフ理論解析（BCT）
・独立成分分析（GIFT，constrained ICAのみ対応）
・ReHo，ALFF解析（REST）

・複数被験者をいっぺんに解析
・複数セッションに対応

やっていることは，それぞれのツールボックスにパラメーター渡して自動で解析してもらっているだけです。


できないこと

・2nd level analysis

集団解析はできないので，SPMやNBSを使ってください。


安静時fMRIだけでなく，課題ベースのfMRIにおける前処理も簡単にできます。



作成時間1分のロゴ。そのうちもちっとましなのを作りたい。

ダウンロードはこちら。
https://www.dropbox.com/s/2hwj2tteru2ywcp/cocoa.zip?dl=0

簡易マニュアル
https://www.dropbox.com/s/njz55zibb3c7der/cocoa_manual.pdf?dl=0


インターフェースはこんな感じ。これ以外に設定はなし。



基本，出力先を決めて，Dicomフォルダを指定，解析に使うテンプレートを設定するだけ。