2013-03-12
soft thresholding
kやpで閾値をスライドさせてネットワークを何十も作って,それに対して全部のグラフ理論の指標を算出するのはあまり好みではない。
その後の解析でどの閾値の指標を採用するかで,恣意的になるのも問題。
(なによりもめんどくさい)
そこでsoft thresholdingを採用。
w = ( ( r + 1 ) / 2 ) ^ beta
範囲-1<r<1のネットワークを0<w<1の重み付けされたネットワークに変換する。
この方法でもbetaの値の決め方で恣意的になる要素はあるけど,変換後のネットワークがべき乗法則を満たす最小のbetaを条件にすれば,恣意的にならずに決定される。
元のネットワークが-1<r<1の場合,betaは8が良いらしい。
手持ちのデータでべき乗法則を確認したところ,変換後は見事に(ほぼ)直線になりましたとさ。
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