Sliding-window correlationをもちいた機能的結合評価

Towards a statistical test for functional connectivity dynamics.
Neuroimage. 2015 Jul 1;114:466-70
Authors: Zalesky A, Breakspear M

もめのみ。

MR信号強度の影響

Intensity-based masking: A tool to improve functional connectivity results of resting-state fMRI.
Hum Brain Mapp. 2016 Mar 28;
Authors: Peer M, Abboud S, Hertz U, Amedi A, Arzy S

MR信号の強度減弱によって機能的結合も当然影響を受ける。
なので一定以上の信号値の領域だけマスクして機能的結合を計算するのがいんじゃねっと。
で，下記のスクリプト使ってねということらしい。
http://mind.huji.ac.il/intensity_based_masking.aspx

論文中の図だと扁桃体とかきれてんだけど。。

Comparative Connectomics

Trends in Cognitive Sciences, in press
Martijn P. van den Heuvel, Edward T. Bullmore, Olaf Sporns

もめん。

つんどくん。

cocoa修正

なんか他のツールを使ったあと，cocoaを立ち上げるとGUIの配置がずれる現象を確認。
修正しました。

あとマカクのデータも処理できるようにしたけど，DARTELが使えなかったので古い手法で前処理してます。
また，マカクの場合はCONNとグラフ理論までしかできないです。

https://www.dropbox.com/s/2hwj2tteru2ywcp/cocoa.zip?dl=0