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2015-11-13

ADNI: slice order problem of resting state fMRI data







ICA analysis with slice order [1:48] for Site 002







ICA analysis with slice order [1:2:47 2:2:48] for Site 002


When using slice order [1:48], other all sites showed later pattern.

2015-11-12

ADNIにおけるslice orderの問題

どうもADNIを使った解析の結果が芳しくないとおもっていたら,ある特定のSiteのデータだけがICAで抽出されたDMNが異なるパターンを示していた。
おかしいと思い,いろいろ検討したところ,通常のスライスオーダーがアセンディングで[1:48]となるところ,そのSiteだけはインターリーブで[1:2:47 2:2:48]としなければならない模様。
Siteの番号は002。

ADNIのrsfMRIデータ使っている人たちは自分で気づいたのだろうか。。
それともどこかに情報があったのか。。
気付かずにそのまま解析してたらこえーなー。