安静時ネットワーク間の情報処理の指標としてのネットワークの複雑さ： HumanConnectomeProjectからの知見

Network complexity as a measure of information processing across resting-state networks: evidence from the Human Connectome Project.
Front Hum Neurosci. 2014;8:409
Authors: McDonough IM, Nashiro K

もめのみ。


レクチャーひとつ，授業二つを一日ではしんどかった。
大学院の正規授業とか2名しかいないし。
これ隔年とかにできんのか？？


鎧武，ミッチーがアホすぎて見てられん。
来週は兄弟みたいなので楽しみ。
TQGは六人目が戦隊に馴染む回。
登場→打ち解け→新ロボの流れは鉄板か。

階層的マルコフランダムフィールドを用いた安静時fMRIの機能的ネットワーク評価法

A Functional Networks Estimation Method of Resting-State fMRI Using a Hierarchical Markov Random Field.
Neuroimage. 2014 Jun 17;
Authors: Liu W, Awate SP, Anderson JS, Fletcher PT

すさまじい頑健さ。
これ使いたい。
ツンドク。


あー査読のことすっかり忘れてた。
明日にしよう。

機能的結合と局所血流におけるサーカディアン及び恒常的調整

J Cereb Blood Flow Metab. 2014 Jun 18. doi: 10.1038/jcbfm.2014.109. [Epub ahead of print]
Circadian and homeostatic modulation of functional connectivity and regional cerebral blood flow in humans under normal entrained conditions.
Hodkinson DJ1, O'Daly O1, Zunszain PA2, Pariante CM2, Lazurenko V1, Zelaya FO1, Howard MA1, Williams SC1.

このアブストはあまり良くない。
真似してはいけない。

最近仕事で大量に英語抄録を読んだので，
なんとなく抄録の質の判断ができるようになった気がする。
やっぱり質の高い抄録ってのは読むだけで全容が想像しやすい感じ。
いいもん見つけたので自分用備忘録。
http://www.cbs.umn.edu/sites/default/files/public/downloads/Annotated_Nature_abstract.pdf
<<アブスト　書き方 abstract how to>>


TQG六人目は割りと良かった。
関根さんもそのうちTQGになる前ふりなのか？
鎧武はミッチーが死亡フラグ立てまくってる。
どう決着をつけるのやら。

脳梗塞後の認知的回復におけるデフォルトうんたん

Significance of longitudinal changes in the default-mode network for cognitive recovery after stroke.
Eur J Neurosci. 2014 Jun 16;
Authors: Park JY, Kim YH, Chang WH, Park CH, Shin YI, Kim ST, Pascual-Leone A

うんたん。


prontoをスクリプトで動かすことができた。
matlabのcfg?じゃなくて，prontoのcｆgっぽいもの(？)を介して動かす模様。
とりあえずADNIデータでパラメーターを作って，
それをうちのデータに適用という流れがだいぶできてきた。
当然ADNIでは高い感度特異度がでるが，
うちのデータに適用するとさっぱり。
バランスを取るのが非常にむずい。
試行錯誤しかないのか。
もちっとスマートになんとかならんか。

グローバルの保存： fMRIによる臨床集団の研究における道具としてのグローバル信号の結合

Save the global: global signal connectivity as a tool for studying clinical populations with fMRI.
Brain Connect. 2014 Jun 12;
Authors: Hahamy A, Calhoun V, Pearlson G, Harel M, Stern N, Atar F, Malach R, Salomon R

global signal connectivityってなんじゃらほい。
この論文ではglobal signalがschizophreniaと関連していたっぽい。

prontoをscript上で使うのがうまくいかない。

ここは絶対に避けて通れない。

matlabbatchのGUIだと動くのに，

scriptだとjobを実行してくれない。

なぜだ。

安静時機能的ネットワーク検出におけるSVMに基づく量的fMRI手法

A SVM-based quantitative fMRI method for resting-state functional network detection.
Magn Reson Imaging. 2014 Apr 13;
Authors: Song X, Chen NK

うんたんうんたん。


離島から土曜に帰出雲。
帰るだけで一日潰れた。


TQGと鎧武はお休みだったらしい。
ざむねむ。

ヒトとマカクの結合間のギャップの架け橋： 全般的な構造－機能的関連とネットワークトポロジーの種間量的比較

J Neurosci. 2014 Apr 16;34(16):5552-63. doi: 10.1523/JNEUROSCI.4229-13.2014.
Bridging the gap between the human and macaque connectome: a quantitative comparison of global interspecies structure-function relationships and network topology.
Miranda-Dominguez O1, Mills BD, Grayson D, Woodall A, Grant KA, Kroenke CD, Fair DA.

”The data showed topological agreement across the species, with nodes of the posterior cingulate showing high degree and betweenness centrality. In contrast, nodes in medial frontal and parietal cortices were identified as having high degree and betweenness in the human as opposed to the macaque. ”
なる。


主人公補正がなかったら，戒斗のほうが強いんじゃなかろうか。
主人公ってば他人から力もらってグダグダやってるだけ。
TQGはついに予告で六人目が登場。

安静時ネットワークは複数の神経パターンで構成される： fMRI研究

Resting network is composed of more than one neural pattern: an fMRI study.
Neuroscience. 2014 May 29;
Authors: Lee TW, Northoff G, Wu YT

もめのみ。


ADNIデータ62人分をぶん回すプログラム書いた。
問題なければ日曜午後には終わっているはず。
解析した気になった。
抄録のネタはこれを元に考える。


びすまるくげっとん。

アルツハイマー病において，代謝低下がうんたんうんたん

In Alzheimer's disease, hypometabolism in low-amyloid brain regions may be a functional consequence of pathologies in connected brain regions.
Brain Connect. 2014 May 28;
Authors: Klupp E, Förster S, Grimmer T, Tahmasian M, Yakushev I, Sorg C, Yousefi B, Drzezga A

もめのみ。
複合スタディ。


なれない仕事で丸一日が終了。
来週LAN環境なしの出張が３日間あるので，
それまでいろいろ片付けなければやばし。
明日は解析しよう。

SPSSにおけるExcelビックデータの読み込み

うまくいかないことが多い。
数値だけのデータならまだしもテキストが入ってるデータだとむずい。
とりあえず，セル内改行を取っ払ってcsvに変換してから読み込むとうまくいくことを確認。
うまく読み込ませるだけで半日かかってしまった。
めもめも。

自分用検索ワード
SPSS，spss，EXCEL，excel，エクセル，変換，読み込み，csv，CSV

安静時と課題条件における機能的ネットワーク結合： 比較研究

Functional network connectivity during rest and task conditions: a comparative study.
Hum Brain Mapp. 2013 Nov;34(11):2959-71
Authors: Arbabshirani MR, Havlicek M, Kiehl KA, Pearlson GD, Calhoun VD

うむ。


眠い。
いろいろと重なってミスしそうで怖い。

安静時fMRIのノードとモードにおいて

On nodes and modes in resting state fMRI.
Friston KJ, Kahan J, Razi A, Stephan KE, Sporns O.
Neuroimage. 2014 May 23. pii: S1053-8119(14)00421-2. doi: 10.1016/j.neuroimage.2014.05.056.

FristonとSporns揃い踏み
著者名だけでツンドク入り。


久しぶりに丸一日休めた。
アメイジング・スパイダーマン2を見に行く。
時間の関係で吹き替えだったのが悔やまれる。
が，頭空っぽにして楽しめた。

鎧武は大将軍のお姿みて笑う。
カッチョワルイ。
TQGはぼちぼち。
追加戦士のよかん。